En general todas las versiones de Ubuntu al instalar php5 y apache2 al mismo tiempo asumían todas las dependencias necesarias para que estos funcionaran.
En este caso en Ubuntu 12.04 no es así, al menos en la versión de Server.
Para solucionarlo simplemente instalamos el paquete conector:
sudo apt-get install php5 libapache2-mod-php5
Con esto debería de solucionarse todo.
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